Habíendose elevado la cota del embalse de la represa a  83 msnm , lo cual implicó que  los sectores de la red ferroviaria entre las ciudades de Garupá y Posadas, en la provincia de Misiones, se vieron  afectados. Por ello la Subsecretaria del Transporte Ferroviario del Ministerio de Planificación Federal, Inversión Pública y Servicios de la Nación, conjuntamente con la Entidad Binacional Yacyretá y la empresa América Latina Logística Mesopotámica (ALL), programaron una serie de acciones que permitirán, en un futuro cercano, no solo mejorar el estado de la infraestructura ferroviaria entre dichas ciudades, sino también poder contar con una nueva Terminal en la ciudad de Posadas y con un servicio de trenes livianos entre esa ciudad y la de Encarnación, en la República del Paraguay.

El programa de obras ferroviarias, para ese sector, comprende básicamente: construcción de la nueva traza ferroviaria de aproximadamente 29 km de extensión. Obras de movimiento de suelo y terraplenes, Construcción de Obras de Arte: Ejecución de un puente ferroviario sobre el Arroyo Zaimán, Construcción de puentes sobre los siguientes cursos de agua: Arroyo Sin Nombre (40 m); Arroyo del Monte (80 m); Arroyo Negro (60 m) y Arroyo Pindapoy (100 m); Construcción de alcantarillas; Tendido de la nueva infraestructura de vía; Provisión e instalación del Sistema de Señalamiento y Telecomunicaciones; Construcción de la nueva Estación Terminal Ferroviaria de Pasajeros Posadas; Construcción de Paradores Ferroviarios de los Servicios Urbanos de pasajeros; Construcción de una nueva Playa de Cargas y refuncionalización de edificios de la actual Playa de Cargas.

Se encuentra en la órbita del Belgrano Cargas y Logística, donde se está estudiando el mejoramiento operativo de este ramal.