La atención en los pasos de frontera son elementos indispensables para un fluido intercambio de personas y cargas que permita la reducción de costos para ambos países y apoye a un mayor desarrollo de la zona fronteriza. La ejecución del proyecto se enmarca en la necesidad de implementar la Decisión Nº 399 de la Comunidad Andina, donde establece la conveniencia del funcionamiento del CEBAF para facilitar el transporte internacional por carretera en la Subregión Andina, el mismo que debe funcionar en las fronteras de los Ejes Viales definidos, ámbito donde se realizan los intercambios comerciales de mercancías y carga, así como de pasajeros, los que requieren de un control integrado. La ubicación de este CEBAF permitirá la mejor intercomunicación entre Perú - Ecuador en el denominado Eje Vial No. 01 del Plan Binacional en la zona del futuro nuevo Puente Aguas Verdes - Huaquillas en la frontera.

Comprende la construcción de un CEBAF de doble cabecera con préstamo de la Comunidad Europea para la PRIMERA ETAPA, la segunda etapa será financiada por cada país.Se han realizado los estudios y actualización de presupuestos para la segunda etapa lado ecuatoriano esta a cargo de la Comisión de Nacional de Transporte terrestre,transito y Seguridad Vial.

El Proyecto de construcción del CEBAF – Lado Ecuador se encuentra financiado por la Unión Europea y Aporte  local, se encuentra  situado en la provincia de El Oro tiene una extensión de 8,90Ha, la compañía constructora a cargo de la ejecución del mismo es Padko, y tiene un avance de obra de 93% y el plazo de culminación vence el 7 de Julio/2010.

A la fecha se ha concluido los trabajos de infraestructura y se conformo la Junta Administradora asi como la aprobacion del respectivo reglamento para su funcionamiento.

Implementacion de los controles migratorios,sanitarios,aduaneros y control de pesos y medidas.

Se establecio la venta del SOAT temporal en el CEBAF, al momento está funcinando como un CEBAF doble cabecera con control integrado. 

Con financiamiento de la Unión Europea, en el mes de julio del 2007 se iniciaron los trabajos de construcción del CEBAF-lado Perú, con una inversión de US$ 7.5 millones. Sin embargo, por causas imputables al contratista, en el mes de abril del 2009 se resolvió el Contrato de obra, los que a esa fecha contaba con un avance de 39.0% y una ejecución financiera de US$ 2.29 millones.

El 16.Set.2010 se iniciaron los trabajos del saldo de obra del CEBAF, con una inversión de US$ 8.50 millones. Las obras culminaron en el mes de mayo del 2011.

El CEBAF Huaquillas – Aguas Verdes, mediante acta suscrita el 28.Feb.2012, fue entregado a la Superintendencia Nacional de Administración Tributaria (SUNAT) para su administración. Vigente desde el 01 de marzo del 2012.